PROFIL BACTERIOLOGIQUE DESHEMOCULTURES CHEZ LES NOUVEAU-NESDANS LES HOPITAUX HEAL AFRICA,KYESHERO ET LA CHARITE MATERNELLE« DU 1er Octobre au 2023 AU 1er Mars 2024 »

11 septembre 2024
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EPIGRAPHE

“N‟avancez rien que vous ne puissiez prouver par l‟expérimentation”

                                                                                                            LOUIS PASTEUR

DEDICACE

Anos très chers parents KASHAVU  KAKIMBA Gratien et NDALINYINCHI LUBUNGO Gervestine.

REMERCIEMMENTS

Nos précieux remerciements s‟adressent à notre Dieu, celui qui nous a donné la grâce d‟être parmi les vivants aujourd‟hui.

Nos sincères remerciements aux autorités académiques de l‟ISTM/GOMA pour la bravoure et la formation scientifique exceptionnelle reçue au sein de l‟institution, en particulier celles de la filière de biologie médicale. Recevez notre gratitude.

Nos remerciements s‟adressent au directeur de ce projet tutoré, le Professeur DANIEL MUKADI, et à notre encadreur le CT FREDERIC HAKIZIMANA  et  Dr. REBECCA

KIDIKIDI qui nous ont accordés leur attention et leur assistance scientifique malgré leurs nombreuses tâches à assumer, recevez ici nos remerciements les plus sincères.

Nos remerciements  à toute l‟équipe de Laboratoire Rodolphe Mérieux INRB-GOMA en particulier celle de bactériologie pour la formation apprise dans l‟apprentissage de perfectionnement au sein du laboratoire de bactériologie, recevez notre gratitude.

Nos sincères remerciements à ma grande sœur BARAKA KASHAVU Francine qui m‟a secouru en assumant certains de mes besoins académiques et non académiques qui m‟ont beaucoup aidé dans l‟élaboration de ce travail. 

Sans oublier à remercier notre autre sœur LINDA KASHAVU, mon beau-frère RUFUMBA Félicien, KABAWA  Irénée  et mes frères MWISHA KASHAVU Richard, AMANI KASHAVU Placide, OKOVU KASHAVU Benjamin, qui m‟ont soutenu et tous

ceux qui ont participé de près ou de loin, sachez que nous vous tenons à cœur et que le Dieu tout puissant vous bénisse.

SIGLES, ABREVIATIONS ET SYMBOLE

ATB : Antibiogramme

AMC : Amoxicilline

AMP : Ampicilline

BCC : Bouillon Cœur-Cervelle

BLSE : Β-Lactamase à Spectre Elargie

CD : clindamycine

E : Erythromycine

GEN : Gentamicine

GSC : Gélose au Sang Cuit 

GSF : Gélose Au Sang Frais

H2O2: Peroxyde d‟hydrogène

ISTM : Institut supérieur des Techniques Médicales 

LRM : Laboratoire Rodolphe Mérieux INRB-GOMA

MC : MacConkey

MSA : Mannitol Salt Agar

PIP : Pipéracilline Tazobactam

SXT : Sulphamethoxazole Triméthroprime

TSB: Triptone Soya Broth

VP: Voges Proskauer

LISTE DE TABLEAUX

TABLEAU  I.  Population  Des Nouveau-nés Inclus …………………………………………………………………. 19

TABLEAU II.    Fréquence de Bactériémies ……………………………………………………………………………. 19

TABLEAU III. Aspect macroscopique Apres Enrichissement ……………………………………………………. 19

TABLEAU IV. Répartition globale de Souches Selon Le Gram …………………………………………………. 20

TABLEAU   V. Répartition de Germes Isoles ………………………………………………………………………….. 21

TABLEAU  VI. Résultat de la sensibilité des souches d‟Escherichia coli isolées …………………………. 22

TABLEAU  VII.  Résultat de la sensibilité des souches de Klebsiella pneumonia ………………………… 22

TABLEAU  VIII.  Résultat de la sensibilité des souches de Pseudomonas spp …………………………….. 23

TABLEAU  IX. Résultat de la sensibilité des souches de Staphylococcus aureus isolées ………………. 23

RESUME

Introduction : Les bactériémies chez les nouveau-nés constituent un problème majeur de santé publique. Au cours de notre étude nous avons voulu  déterminer la fréquence de bactériémies chez les nouveau-nés à l‟hôpital Heal Africa, Kyeshero et La Charité Maternelle,  déterminer les germes responsables des dites bactériémies chez les nouveau-nés dans les  3 différents hôpitaux, de déterminer le profil de sensibilité des germes isolés  dans les hémocultures  chez les nouveau-nés dans ces 3 différents hôpitaux face aux  antibiotiques. 

Matériels et méthodes : Notre étude est du type transversal analytique qui a inclus 175 nouveau-nés ayant présentés les signes d‟infection néonatale et qui ont consulté dans les hôpitaux concernés par notre étude et chez qui un prélèvement d‟hémoculture a été réalisé.

La méthode qualitative nous a permis de ranger les résultats d‟une manière qualitative tandis que pour présenter les résultats chiffrés nous avons utilisé la méthode quantitative dans les tableaux de distribution,  de ce fait le logiciel  Microsoft Excel 2010 et  SPSS Version 25 nous a aidé dans  l‟encodage et traitement de données et Microsoft Word 2010 pour la saisie de données.

Résultats : Au cours de notre étude, nous avons observé une fréquence d‟hémoculture positive  évaluée à 38,86 %, les bactéries à gram négatifs ont été les germes les plus isolés à 79,41 (%) alors que les bactéries à gram positif ont représentés 20,59 (%).  Nous avons isolés au total 11 souches  Staphylococcus aureus  avec 13 souches soit   (19,12) suivie de

Klebsiella pneumoniae avec 12 souches soit  (17,65).  L‟amikacine a été l‟antibiotique le plus efficace par rapports aux souches testés. Néanmoins une forte résistance a été observée à l‟ampicilline, à la cotrimoxazole,  à „amoxicilline, à la Ceftriaxone et à la cefixime.

Conclusion : En bref, dans notre étude, nous avons constaté une forte fréquence des bactériémies chez les nouveau-nés et une forte résistance de germes face aux antibiotiques ce qui suscite une forte surveillance préventive, diagnostic et curative pour résoudre ce problème majeur de santé publique.

Mots clés : Profil, Hémoculture, Nouveau-nés.

ABSTRACT

Introduction: Bacteremia in newborns constitutes a major problem of public health. During our study we wanted to determine the frequency of bacteremia in newborns at Heal Africa, Kyeshero and La Charité Maternelle hospitals, determine the germs responsible for said bacteremia in newborns in the 3 different hospitals, and determine the sensitivity profile of germs isolated in blood cultures from newborns in these 3 different hospitals to antibiotics.

Materials and methods: Our study is of the transversal analytical type which included 175 newborns who presented with neonatal infections and who consulted in the hospitals concerned by our study and from whom a blood culture sample was taken

The qualitative method allowed us to organize the results in a qualitative way while to present the numerical results we used the quantitative method in the distribution tables, therefore the software Microsoft Excel 2010 and SPSS Version 25 helped us in data encoding and processing and Microsoft Word 2010 for data entry.

Results: During our study, we observed a frequency of positive blood culture estimated at 38.86%, gram-negative bacteria were the most isolated germs at 79.41 (%) while grampositive bacteria represented 20.59 (%). We isolated a total of 11 Staphylococcus aureus strains with 13 strains, i.e. (19.12), followed by Klebsiella pneumonias with 12 strains, i.e. (17.65). Amikacin was the most effective antibiotic in relation to the strains tested. However, strong resistance has been observed to ampicillin, cotrimoxazole, amoxicillin, ceftriaxone and cefixime.

Conclusion: In short, in our study, we noted a high frequency of bacteremia in newborns and a strong resistance of germs to antibiotics, which calls for strong preventive diagnostic and curative surveillance to resolve this major public health problem.

Keywords: Profile, Blood culture, Newborns

TABLE DE MATIERES

EPIGRAPHE…………………………………………………………………………………………………………………… i

 DEDICACE…………………………………………………………………………………………………………………… ii

REMERCIEMMENTS………………………………………………………………………………………………………. iii

SIGLES, ABREVIATIONS ET SYMBOLE………………………………………………………………………. iv

LISTE DE TABLEAUX……………………………………………………………………………………………………….. v

RESUME…………………………………………………………………………………………………………………….. vi

ABSTRACT………………………………………………………………………………………………………………. vii

TABLE DE MATIERES……………………………………………………………………………………………………. viii

CHAPITRE  I. INTRODUCTION……………………………………………………………………………………………. 1

I.1.  EPIDEMIOLOGIE…………………………………………………………………………………………………… 1

I.2. PROBLÉMATIQUE………………………………………………………………………………………………….. 2

I.3.  QUESTIONS DE RECHERCHE…………………………………………………………………………………….. 2

I.6.  CHOIX DU SUJET…………………………………………………………………………………………………… 3

INTERETS DU SUJET…………………………………………………………………………………………………….. 4

I.7. DELIMITATION TEMPOROSPATIALE DU TRAVAIL………………………………………………………….. 4

I.8. SUBDIVISION DU TRAVAIL……………………………………………………………………………………….. 4

CHAPITRE II. GÉNÉRALITÉS SUR LES HEMOCULTURES ET BACTERIÉMIES……………………………………. 5

II.1. DÉFINITIONS DE CONCEPTS…………………………………………………………………………………….. 5

II.2. ETIOLOGIE ET FACTEURS DE RISQUE…………………………………………………………………………. 5

II.3. PATHOGENIE DE BACTERIEMIES………………………………………………………………………………. 6

II.4. MANIFESTATIONS CLINIQUES………………………………………………………………………………….. 7

II.5. DIAGNOSTIC DE BACTERIEMIES……………………………………………………………………………….. 7

II.6. COMPLICATIONS DE BACTERIEMIES CHEZ LES NOUVEAU-NES………………………………………. 11

II.7. PROPHYLAXIE…………………………………………………………………………………………………….. 11

CHAPITRE III. MATERIEL  ET METHODES…………………………………………………………………. 13

III.1. CADRE D’ETUDE…………………………………………………………………………………………………. 13

III.2. TYPE D’ETUDE……………………………………………………………………………………………………. 14

III.3. POPULATION D’ETUDE………………………………………………………………………………………… 14

III.4. CRITERES DE SELECTION (INCLUSION ET EXCLUSION)…………………………………………………. 14

III.4.1. Critères d’inclusion……………………………………………………………………………………….. 14

III.4.2. Critères d’exclusion………………………………………………………………………………………. 14

III.5. TECHNIQUE D’ECHANTILLONNAGE ET TAILLE DE L’ECHANTILLON…………………………………. 14

III.6. TECHNIQUES DE RECOLTE DE DONNEES………………………………………………………………….. 15

III.7. METHODES ET APPROCHE D’ANALYSE DES DONNEES…………………………………………………. 17

III.8.  VARIABLES A ETUDIER………………………………………………………………………………………… 17

III.9. SAISIE ET TRAITEMENT DES DONNEES…………………………………………………………………….. 17

III.10. CONSIDERATIONS ETHIQUES………………………………………………………………………………. 18

CHAPITRE IV. RESULTATS……………………………………………………………………………………….. 19

CHAPITRE V. DISCUSSION DE RESULTATS……………………………………………………………….. 24

CHAPITRE VI. CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS……………………………………………… 27

ANNEXES……………………………………………………………………………………………………………….. EE

CHAPITRE  I. INTRODUCTION

I.1.  EPIDEMIOLOGIE

 La bactériémie chez les nouveau-nés se réfère à la présence de bactéries dans la circulation sanguine. Cette condition est le résultat d’une infection bactérienne qui peut avoir des conséquences graves chez les nourrissons en raison de leur système immunitaire immature [1].

Dans le monde, on estime que ce sont 22 enfants pour 1000 naissances vivantes qui  développent un sepsis néonatal. Malgré les progrès importants dans la prise en charge de ces infections, la mortalité reste préoccupante [2].

Les infections néonatales constituent un problème majeur de santé publique car  elles entrainent une mortalité élevée entre 3 % à 5 % dans les pays en développement. Ces infections survenant dans le premier mois de la vie sont responsables de cinq millions de morts par an dans le monde. En France, les streptocoques du groupe B et Escherichia coli t en sont la cause dans 80 % des cas des infections néonatales primitives. L‟analyse des antibiogrammes a montré que les Streptocoques du groupe B (SGB) et les autres streptocoques gardent leur sensibilité habituelle à l‟ampicilline. E. Coli a présenté respectivement une sensibilité de 48 et de 100 % à l‟ampicilline et aux céphalosporines de 3ème génération (C3G) [3,4].

   L‟étude menée par Abdoul Karim Doumbia au centre hospitalo-universitaire Gabriel Touré sur les infections néonatales à Bamako, a révélé que sur 52 hémocultures réalisées , les isolats obtenus étaient en grande partie constitués  les cocci à Gram positifs (Staphylococcus aureus à 55,77% et streptococcus agalactiae à 3,84% et les bacilles à Gram négatif entre autre Klebsiella pneumoniae à 13,46% et Escherichia coli à 7,69 %  , la sensibilité a été observée au ciprofloxacine et à l‟amikacine à 100% avec une mortalité de 50% [5].

En 2021, Aux Cliniques Universitaires de Lubumbashi et à l‟hôpital Général Provincial de Référence Jason Sendwe, la fréquence de la septicémie dans les unités de soins intensifs néo-natologiques a été évaluée à 31,39% [6]

Aux Cliniques Universitaires de Kinshasa en 2015, la présentation clinique néonatale était polymorphe et non spécifique, principalement la perturbation de l’examen neurologique.

Les hémocultures étaient positives dans 9,95% des cas [7]

Malheureusement les données épidémiologiques sur les bactériémies chez les nouveau-nés au Nord-Kivu et à Goma ne sont pas disponibles.

I.2. PROBLÉMATIQUE

Les infections néonatales constituent un problème de santé publique suite à la forte morbi-mortalité péri natale due en grande partie par les bactéries principalement les entérobactéries et les coques à Gram positif [3,4].

Plusieurs études ont été menées afin d’objectiver la place importante qu’occupent ces infections dans la mortalité néonatale. En 2015, l’OMS estimait à 47.6% les décès liés à l’Infection néonatale (INN) [8] Cette forte mortalité est causée souvent par l‟immaturité du système immunitaire du nouveau-né, la détection tardive de l‟infection, la résistance aux antibiotiques [9]. 

Dans la prise en charge de bactériémie il est crucial de procéder à l‟identification du germe responsable de la bactériémie et déterminer son profil de sensibilité aux antibiotiques.

Fort malheureusement suite au déficit du plateau technique dans nos laboratoires à ressources limitées, la mise en évidence du germe responsable de la bactériémie est difficile, de ce fait le personnel de santé fait recourt à une antibiothérapie probabiliste ayant comme conséquence la sélection des souches résistantes et des décès par traitement inapproprié.

Ainsi nous avons jugé indispensable de mener une étude qui va chercher à identifier les germes responsables de bactériémies chez les nouveau-nés et de tester leur profil de sensibilité aux antibiotiques en vue d‟améliorer leur prise en charge.

I.3.  QUESTIONS DE RECHERCHE

Question principale

Quel est le Profil bactériologique des hémocultures chez les nouveau-nés dans les Hôpitaux  Heal Africa, Kyeshero et la Charité Maternelle ?  

Questions spécifiques
  • Quel est la fréquence des bactériémies chez les nouveau-nés aux Hôpitaux : Heal Africa, Kyeshero et la charité maternelle ?
  • Quels sont les germes responsables des bactériémies chez les nouveau-nés dans les 3 différents Hôpitaux ?
  • Quel est le profil de sensibilité de germes isolés dans les bactériémies chez les nouveau-nés à ces 3 différents Hôpitaux  face aux antibiotiques ?
I.4.  HYPOTHESES 
  • La fréquence des bactériémies chez les nouveau-nés aux Hôpitaux Heal Africa, Kyeshero et la charité maternelle serait élevée.
  • E. coli, K. pneumoniae, S. aureus seraient les germes les plus rencontrés comme responsables de bactériémies dans ces différents Hôpitaux.
  • Les bactéries impliquées dans les bactériémies dans ces trois différents Hôpitaux seraient sensibles à l‟amikacine et à l‟ampicilline.
I.5. OBJECTIFS DU TRAVAIL
Objectif général

Déterminer le Profil bactériologique des hémocultures chez les nouveau-nés dans les

Hôpitaux  Heal Africa, Kyeshero et la Charité Maternelle  

Objectifs spécifiques
  • Déterminer la fréquence de bactériémies chez les nouveau-nés aux Hôpitaux Heal Africa, Kyeshero et la charité maternelle.
  • Déterminer les germes responsables des bactériémies chez les nouveau-nés dans les 3 Hôpitaux.
  • Déterminer le profil de sensibilité de germes isolés dans les bactériémies  chez les nouveau-nés dans ces 3 différents Hôpitaux  face  antibiotiques. 

I.6.  CHOIX DU SUJET

Nous avons porté notre choix sur le profil bactériologique de bactériémies chez les nouveau-nés dans la ville de Goma, du fait que nous avons constaté pendant notre stage que les fièvres inexpliquées pendant la période néonatale étaient soignées avec une antibiothérapie probabiliste avec risque de sélection de souches résistantes et décès par traitement inappropriée.

Cette étude permettra d‟identifier les bactéries responsables de ces bactériémies et déterminer leur profil de sensibilité aux antibiotiques pour une meilleure prise en charge. 

INTERETS DU SUJET

  • Intérêt communautaire : ça va aider à guider et informer le personnel soignant   dans la prise en charge des bactériémies chez les nouveau-nés.
  • Intérêt scientifique : ce travail va servir de référence pour les autres chercheurs qui traiteront sur un sujet similaire.
  • Intérêt personnel : Ce travail nous permettra d‟approfondir les connaissances théoriques et pratiques en Bactériologie.

I.7. DELIMITATION TEMPOROSPATIALE DU TRAVAIL 

  • Délimitation spatiale : notre étude s‟est déroulée au Nord-Kivu, dans la ville de

GOMA.

  • Délimitation temporaire : notre étude s‟est effectuée durant une période allant du 1/10/2023 au 1/03/2024.

I.8. SUBDIVISION DU TRAVAIL

Notre travail est subdivisé en 6 chapitres dont :

CHAPITRE  I.  Introduction CHAPITRE  II. Généralités Sur Les Hémocultures et les  Bactériémies CHAPITRE  III.  Matériel et Méthodes  CHAPITRE  IV. Résultats CHAPITRE V. Discussion CHAPITRE  VI. Conclusion Et Recommandations

CHAPITRE II. GÉNÉRALITÉS SUR LES HEMOCULTURES ET BACTERIÉMIES

II.1. DÉFINITIONS DE CONCEPTS

  • Bactériémie : La bactériémie est définie comme la présence des  bactéries d‟une manière éphémère ou chronique dans la circulation sanguine [10].
  • Bactérie : c’est un microorganisme unicellulaire procaryote ayant comme matériel génétique ADN et se reproduisant par scissiparité [13].
  • Bactériologie : est la branche de la microbiologie qui étudie les bactéries, leur structure, leur fonctionnement et leur rôle dans les maladies infectieuses.[12].
  • Hémoculture : consiste à mettre en culture un échantillon de sang circulant, afin d’identifier un ou plusieurs germes responsables d‟une bactériémie.  [14].
  • Nouveau-né : c‟est un enfant qui a un âge qui se situe entre 0 et 28 jours [11].

II.2. ETIOLOGIE ET FACTEURS DE RISQUE

II.2.1. ETIOLOGIE

Un grand nombre de microorganismes peuvent être agents de bactériémie mais leur incrimination n’est pas toujours facile. On distingue :

  • Les agents pathogènes spécifiques : Leur isolement d’une hémoculture établit le diagnostic d’emblée car ils sont associés à une pathologie infectieuse donnée. C’est le cas des Salmonelles (S.typhi et S.paratyphi) , des Brucelles , du Méningocoque et  du Pneumocoque. 
  • Les agents pathogènes opportunistes : Leur incrimination s’appuie sur la fréquence de leur isolement en hémoculture, la ou les portes d’entrée potentielles dans l’organisme et le statut immunitaire du patient. En effet, ces agents font partie de la flore normale du corps humain et animal et sont même parfois des saprophytes de l’environnement. Leur caractère ubiquitaire en fait de fréquents contaminants des milieux de culture et le microbiologiste ne peut statuer sur leur rôle dans le syndrome infectieux sans l‟aide d‟une fiche de renseignements cliniques détaillée.

On suspecte souvent une ou plusieurs portes d‟entrée, en particulier en milieu hospitalier. On peut distinguer entre autres, les Staphylocoques (espèce aureus ou à coagulase négative), les Entérocoques mais beaucoup plus souvent des bacilles à gram négatif tels les Entérobacterales et Pseudomonas aeruginosa. De même, on assiste depuis une vingtaine d’années à l’émergence croissante en milieu hospitalier, de microorganismes appelés nouveaux agents d’infection nosocomiale, connus jusqu’alors comme de banales bactéries de l’environnement : Nous citerons Acinetobacter baumanii et Stenotrophomonas maltophilia. Ces germes jouent un rôle non négligeable comme agent d’infections nosocomiales et sontsouvent difficiles à éradiquer à cause de leur multi résistance aux antibiotiques [15].  

Dans le cas particulier chez les nouveau-nés les agents bactériens  responsables de bactériémies comprennent les germes classiques, les entérobactéries  (principalement

Escherichia coli, klebsiella, Enterobacter,…), les streptocoques du groupe B et les autres germes :  Haemophylus influenzae [15].

 II.2.2.  FACTEURS DE RISQUE

Les facteurs de risque de bactériémie chez le nouveau-né à terme sont : 

  • Bactériurie chez la mère dans les 2 dernières semaines avant l‟accouchement non traitée  
  • Rupture prolongée des membranes de plus de 12 heures
  • Travail prolongé
  • Examens locaux (touchers vaginaux répétés)
  • La prématurité  [16].

II.3. PATHOGENIE DE BACTERIEMIES

Il existe 3 modes de transmission dans la pathogénie des bactériémies chez les nouveau-nés dont : 

  • Avant l’accouchement : Une infection chez le fœtus, qui peut se produire à tout moment par voie hématogène transplacentaire.
  • Pendant l’accouchement : La contamination peut se faire aussi au cours de l‟accouchement lors du passage dans la filière génitale. 
  • Après l’accouchement : après la naissance l‟enfant peut être contaminé par des bactéries se trouvent dans l‟environnementhospitalier ou familial.  Elles peuvent être transmises par le personnel médicale, d‟autres patients ou par des équipements médicaux contaminés. [17].

 II.4. MANIFESTATIONS CLINIQUES

Le sang est normalement stérile, un état septicémique ou plus généralement un « état infectieux grave » se caractérise par un passage répété de microbes dans le sang ;

Les manifestations cliniques sont nombreuses et aspécifiques. Les signes cliniques initiaux sont : Instabilité thermique (hypothermie ou hyperthermie), diminution de l’activité spontanée, Succion moins vigoureuse, Anorexie, Apnée, Bradycardie, etc. [17].

II.5. DIAGNOSTIC DE BACTERIEMIES

Certains examens comme les Paramètres Hématologiques et biochimiques peuvent également intervenir dans l‟orientation du diagnostic d‟une bactériémie chez les nouveau-né. Comme par exemple : 

  • Numération globulaire complète (NGC) : Cela inclut le nombre de globules blancs, de globules rouges et de plaquettes. Une augmentation du nombre de globules blancs (leucocytose) peut être observée en cas d’infection bactérienne.
  • Formule leucocytaire : Cela permet d’évaluer la proportion de différents types de globules blancs, tels que les neutrophiles, les lymphocytes, les monocytes, etc. Une augmentation du pourcentage de neutrophiles (neutrophile) peut indiquer une réponse à une infection bactérienne [18].

Egalement certains paramètres biochimiques comme : 

  • Protéine C-réactive (CRP) : La CRP est une protéine qui augmente en réponse à une inflammation, y compris en cas d’infection bactérienne.
  • Procalcitonine : Ce marqueur peut être élevé en cas d’infection bactérienne systémique.
  • Lactate : L’élévation du lactate peut indiquer une réponse métabolique à une infection sévère [19].

L‟hémoculture constitue le seul moyen permettant d‟isoler et d‟identifier l‟agent responsable de bactériémies (les bactéries), et déterminer son profil de sensibilité aux antibiotiques.

v PRELEVEMENT

Réalisation de prélèvement

Le prélèvement de qualité est le préalable à tout examen de bactériologie, le prélèvement du sang pour hémoculture doit satisfaire à plusieurs critères ou exigences.

Ø Eviter les contaminants et travailler en sécurité

  • L‟antisepsie de la peau doit se faire successivement avec de l‟alcool à 70% puis un produit iodé, une à deux minutes de contact sont nécessaires pour obtenir l‟effet antiseptique maximal de la polyvidone iodée, après la ponction veineuse, le produit iodé potentiellement irritant est enlevé avec de l‟alcool à 70%.
  • La désinfection du capuchon du flacon d‟hémoculture est réalisée avec l‟alcool à 70% ou un produit iodé que l‟on laisse sécher avant l‟usage.
  • La ponction veineuse est la seule méthode de prélèvement du sang pour la culture, les autres sites de prélèvement notamment les recueils de sang par cathéter augmente de façon significative la fréquence des contaminants

Ø prélever une quantité suffisante

La densité des bactéries présentes dans le sang est généralement très faible, de ce fait il existe une relation entre le volume de sang inoculé dans les flacons d‟hémoculture et le rendement de la technique

La dilution au 1/10 est celle qui donne le meilleur résultat, car elle permet d‟inactiver l‟effet bactéricide du sang, cependant une dilution inferieur, jusqu‟à 1/5 est encore possible, quand à une dilution supérieure à 1/10, elle est sans inconvénient si non de réduire la quantité de sang inoculé, au total plus grand est le volume du bouillon dans le flacon, meilleur est l‟effet de la dilution, utiliser des flacons contenant un plus petit volume de bouillon pour hémocultures de pédiatrie n‟apporte pas d‟avantage significatif. 

Exemple : pour les nouveau-nés on prélève 2,5 ml du sang contre 25 ml du bouillon cœurcervelle.

Pour un prélèvement avec un dispositif à ailettes, l‟air dans la tubulure fait que le flacon aérobie doit être ensemencé en premier.

Pour un prélèvement à la seringue, il faut ensemencer en premier le flacon anaérobie Transport

Les hémocultures inoculées sont acheminées au laboratoire sans tarder.

Lorsque le laboratoire utilise un automate d‟hémoculture, pour éviter que la croissance bactérienne débute avant le dépôt des flacons dans l‟automate, il est recommandé de ne pas placer les flacons ensemencés à 37°C.

COMPOSITION DU BOUILLON CŒUR-CERVELLE
  • protéose-peptone 10,0 g
  • Infusion de cervelle de veau 12,5 g
  • Infusion de cœur de bœuf 5,0 g
  • Glucose 2,0 g
  • Chlorure de sodium 5,0 g
  • Hydrogénophosphate de sodium
  • pH = 7,4

Ø 1ère méthode

DÉTECTION VISUELLE DE LA CROISSANCE

Deux systèmes à détection visuelle sont actuellement disponibles en France :

Bio Mérieux commercialise un flacon liquide anaérobie et un flacon diphasique aérobie (Hemoline™ Performance Duo).

Le flacon diphasique : possède une phase liquide et une phase solide gélifiée ce qui présente plusieurs avantages :

D‟abord, on peut réaliser les subcultures sans risques de contamination. En effet, il suffit d‟une simple inclinaison du flacon pour ensemencer la partie gélosée ;

Ensuite l‟observation des cultures est facile,

Le fait de disposer de colonies isolées améliore l‟orientation du diagnostic Enfin les protocoles standardisés de nombreux tests pourront être respectés grâce à la culture obtenue sur la phase gélosée comme l‟antibiogramme, les tests et galeries rapides d‟identification.

Oxoïd commercialise un flacon Signal®

Hémoculture Signal® utilise un seul milieu liquide pour la culture des germes aérobies et anaérobies. Après ensemencement du flacon avec le sang du patient, on fixe un indicateur muni d‟une longue aiguille sur ce flacon. Après incubation et dans le cas d‟une hémoculture positive, les gaz (CO2, acides gras volatils) produits par les bactéries créent une augmentation de pression dans le flacon. Cette augmentation de pression entraine un déplacement, à travers l‟aiguille, du contenu du flacon en direction de l‟indicateur. Ainsi, la présence de bouillon dans l‟indicateur signifie que l‟hémoculture est positive. On poursuit l‟analyse à partir du contenu de l‟indicateur [20].

– Flacon marque Bact Alert 

Détection optimale de micro-organismes, dont les bactéries, les champignons/levures et les mycobactéries dans les hémocultures.

Une gamme large de milieux adaptée aux besoins des microbiologistes. Ces milieux sont validés sur différents types d‟échantillons, du sang aux fluides biologiques normalement stériles. La technologie colorimétrique associée à des algorithmes optimisés minimise le risque de résultats faux négatifs. Les flacons en polycarbonate incassables répondent aux exigences de sécurité  pour le transport des flacons dans les établissements de santé et les laboratoires de biologie médicale. La détection colorimétrique est une technologie reconnue pour la culture automatisée des hémocultures.

Les micro-organismes présents dans le milieu produisent du CO2 lors de leur phase de croissance. Le CO2 produit induit une diminution du pH du milieu de culture. Ce changement de pH induit le virage colorimétrique d‟un sensor composé de silicone imprégné de détecteurs d‟émulsion liquide (LES), déposé au fond de chaque flacon. Une LED envoie un faisceau lumineux sur le sensor. Une Photodiode collecte l‟intensité de lumière réfléchie par le sensor sous la forme d‟unité de réflectance. Les unités de réflectance sont analysées dans le temps.

Les flacons sont lus toutes les 10 minutes. 3 algorithmes optimisés, parmi lesquels un algorithme « seuil » unique, assurent une détection rapide des micro-organismes. En cas d‟introduction différée des flacons, le personnel du laboratoire peut réaliser un contrôle visuel rapide du sensor pour identifier les flacons positifs avant leur introduction dans l‟automate.

De cette façon, vous êtes assurés d‟une prise en charge.

Ø 2ème méthode

La 2ème méthode utilise un milieu d‟enrichissement, le bouillon Cœur-cervelle. Après ensemencement du flacon avec le sang du patient, le milieu est incubé. Un contrôle visuel est réalisé Deux fois par jour les deux premiers jours, et une fois par jour jusqu‟au 7ème jour à la recherche des signes de positivité, témoin d‟une croissance bactérienne. Ces signes sont la turbidité, l‟hémolyse, la production de gaz, la formation d‟un coagulum, et la présence des colonies au fond du flacon. Après signes de positivité on passe à une subculture et finir l‟identification et l‟antibiogramme.

II.6. COMPLICATIONS DE BACTERIEMIES CHEZ LES NOUVEAU-NES

Les complications graves, en particulier en raison de leur immunité encore en développement :  

  • Sepsis Néonatal : La bactériémie non traitée peut évoluer vers un état de sepsis, une réponse inflammatoire systémique du corps à l’infection. Le sepsis néonatal peut être fatal s’il n’est pas rapidement diagnostiqué et traité.
  • Infections Métastatiques : Les bactéries présentes dans la circulation sanguine peuvent se propager à d’autres organes, provoquant des infections secondaires telles que la méningite, la pneumonie, l’ostéomyélite et les infections du système urinaire.
  • Choc Septique : Dans les cas graves de sepsis, une défaillance des organes peut survenir, entraînant un état de choc septique. Cela peut mettre la vie du nourrisson en danger et nécessiter des soins intensifs [21].

II.7. PROPHYLAXIE

  • Dépistage et traitement des infections urinaires pendant la grossesse
  • Antibiothérapie adaptée aux  infections cervico vaginales et des voies urinaires pendant la grossesse ;
  • Antibiothérapie per-partum intraveineuse des femmes fébriles >38°C ou porteuses des infections urinaires : cette attitude diminue le nombre des formes précoces graves d’infections materno-foetales (septicémie, méningite) mais interfère sur les résultats bactériologiques des nouveau-nés [22].

CHAPITRE III. MATERIEL  ET METHODES

III.1. CADRE D’ETUDE

A. Dénomination de l’institution : nous avons mené notre étude dans les hôpitaux ci-

après : KYESHERO, HEAL AFRICA, LA CHARITE MATERNELLE dont la délimitation est présentée ci-dessous : 

Ø Situation géographique de l’hôpital Heal Africa

Elle est située au sud de la ville de Goma, dans la commune de GOMA, Avenue des Rondspoints N°111, à côté de la Banque de Développement de Pays de Grands Lacs (BDGL) ; Ses limites :

  • Au Nord : par hôtel MULINGA
  • Au Sud : par l‟église MEPAC 
  • A l’Est : par la Banque Centrale du Congo
  • A l’Ouest : par la société Pinacle Security.

Ø Situation géographique de l’hôpital KYESHERO

L‟hôpital KYESHERO est situé en République Démocratique du Congo, Province du Nord – Kivu, Ville de Goma quartier KYESHERO en face de IBRA radio et l‟église Philadelphie et de l‟université libre des pays de Grands Lacs. 

Ø Situation géographique de l’hôpital La Charité Maternelle

  • Au Nord : par la route du rond-point Rutshuru vers la petite barrière ;
  • Au Sud : par la route qui part du rond-point indépendance (BDGL) vers la grande barrière
  • A L’Est : par la zone frontalière qui sépare la ville de Gisenyi et celle de Goma
  • A L’ouest : par le boulevard KARISIMBI qui part du rond-point de l‟indépendance (BDGL) vers le rond-point Rutshuru.

D‟où nous avons procédé au prélèvement des échantillons et les analyses au laboratoire se sont déroulés au laboratoire Rodolphe Mérieux de l‟Institut National de Recherches

Biomédicales GOMA (LRM INRB/Goma)

B. Situation géographique du LRM INRB/GOMA

Le LRM INRB /GOMA, est situé en RDC dans la province du Nord-Kivu Commune de Goma, Quartiers de volcan dans la Zone de Santé de Goma. 

III.2. TYPE D’ETUDE

Notre étude est transversale analytique.

III.3. POPULATION D’ETUDE

La population de notre étude était constituée de tout nouveau-né âgé de 0 à 28 jours ayant présenté les signes d‟infections néonatales et qui a consulté dans les établissements des soins concernés pendant la période de notre étude.

III.4. CRITERES DE SELECTION (INCLUSION ET EXCLUSION)

III.4.1. Critères d’inclusion

Nous avons inclus dans notre étude, tout nouveau-né ayant présenté au moins un des signes suivants : Fièvre, hypothermie, Irritabilité, difficulté à téter ou anorexie, troubles respiratoires, problèmes gastro-intestinaux, qui a consulté dans un des établissements de soins concerné par notre étude et auprès de qui le prélèvement de l‟hémoculture a été réalisé.

III.4.2. Critères d’exclusion

Nous avons   exclu dans  notre étude tout nouveau-né :

Ø Ayant présenté les signes cités ci-haut et qui a consulté dans l‟établissement de soins concernés mais chez qui aucun prélèvement n‟a été réalisé

III.5. TECHNIQUE D’ECHANTILLONNAGE ET TAILLE DE L’ECHANTILLON

Nous avons procédé à un échantillonnage par convenance, de ce fait notre taille de l‟échantillon s‟élève à 175 cas de nouveau-nés ayant subi un prélèvement sanguin pour hémoculture.

  • 74 nouveau-nés à l‟Hôpital Heal Africa
  • 48  nouveau-nés à l‟Hôpital Kyeshero
  • 53 nouveau-nés à l‟Hôpital La Charité Maternelle.

III.6. TECHNIQUES DE RECOLTE DE DONNEES

Pour collecter les données nous avons utilisé les techniques suivantes : 

  • L’analyse documentaire : cette dernière nous a permis de consulter les différents documents « livres, revues, articles, notede cours et sites internet » à rapport avec le sujet de notre recherche.
  • Analyse de laboratoire : cette technique nous a permis de faire recours aux prélèvements des échantillons dans le service concerné par les nouveau-nés au niveau de ces 3 hôpitaux puis acheminés au LRM INRB/ GOMA pour les analyses.

Au cours de ces analyses, les étapes suivantes ont étés respectées :

  • Le prélèvement
  • L‟enrichissement 
  • La coloration de Gram d‟orientation 
  • L‟isolement
  • La coloration de Gram de pureté
  • L‟identification
  • L‟antibiogramme
LA DEMARCHE UTILISEE PENDANT NOTRE RECHERCHE 

v Signes évocateurs d’une bactériémie chez les nouveau-nés

Les hémocultures ont été prélevées chez tout nouveau-né qui a présenté la fièvre ou hypothermie, irritabilité, difficulté à téter ou anorexie, troubles respiratoires et problèmes gastro-intestinaux. 

v Prélèvement Réalisation de prélèvement

Afin d‟éviter les contaminants, le prélèvement a été réalisé après désinfection au préalable du site de prélèvement avec de l‟alcool à 70% puis un produit iodé. Une à deux minutes de contact a été nécessaire pour obtenir l‟effet antiseptique maximal de la polyvidone iodée. Ensuite, nous avons posé le garrot et prélevé par ponction veineuse de 2,5 ml de sang. Puis nous avons désinfecté le capuchon du flacon de l‟hémoculture, le bouillon cœur-cervelle, avec la polyvidone iodée et y avons inoculé le sang prélevé. 

v ANALYSE DE LABORATOIRE

Durée d’incubation des flacons d’hémoculture

Nous avons incubé à 35±2°C pendant 7 jours tout en observant les signes de positivité. 

Examen macroscopique du flacon

Deux fois par jour, les flacons sont inspectés en vue de rechercher des signes témoignant d‟une croissance visible qui sont la turbidité, l‟hémolyse, la formation du coagulum, l‟apparition d‟un voile, la production de gaz,  flacon à l‟interphase bouillon-sédiment et verdissement. 

 Analyse au laboratoire proprement dit Ø Au 1er jour de la visualisation des signes de positivité

  • Nous avons d‟abord fait l‟examen microscopique entre lame et lamelle où nous recherchons la présence des bactéries
  • Nous avons ensuite procédé à la coloration de Gram, concernant la procédure voir (annexe) 
  • Puis, nous avons ensemencé par la méthode d‟épuisement autour d‟une source de chaleur une goutte d‟inoculum de cœur cervelle sur un milieu général, la gélose au sang (GS), et sur milieu spécifique aux bacilles à Gram négatifs, le MacConkey (MC), puis incubés à 37°C pendant 18 à 24 heures. 

Ø Au 2ème jour

Le lendemain après isolement, la coloration des Gram est réalisée et nous a permis ainsi de lancer l‟identification selon que l‟on est devant des bactéries à Gram positif ou négatif.

  • Les staphylocoques l‟ont été sur base des caractères morphologiques et biochimiques (Cocci à Gram positif en amas, présence de catalase et de coagulase, la fermentation du mannitol et la sensibilité ou non à la novobiocine)
  • Concernant les bacilles à Gram négatifs, les colonies ont été repiquées sur la galerie minimale de Léminor, incubé pendant 18 à 24 heures à 35±2°C puis identifiés le lendemain selon les abaques.

Ø Au 3ème jour

Nous avons procédé à l‟identification et avons lancé l‟antibiogramme par méthode de diffusion des disques sur gélose avec le Muller Hinton selon le germe isolé. 

Nous avons préparé une suspension bactérienne à partir d‟une colonie pure de la souche bactérienne prélevée et suspendue dans un tampon physiologique stérile pour obtenir une densité comparable à un échantillon normalisé à 0,5 Mac Farland.

Nous avons incubé l‟inoculum pendant 15 minutes avant de l’ensemencer uniformément sur la surface de la gélose Muller Hinton. À l’aide d’un écouvillon stérile. 

Nous avons ensuite placé les disques imbibés d’antibiotiques spécifiques sur la surface de la gélose en enfonçant légèrement. La sélection de disques d’antibiotiques dépend de la souche identifiée en se référant dans le manuel du comité d‟antibiogramme.

III.7. METHODES ET APPROCHE D’ANALYSE DES DONNEES

  • La méthode qualitative : cette méthode nous a permis d‟isoler et d‟identifier les germes responsables des bactériémies et déterminer leur sensibilité aux antibiotiques.
  • La méthode quantitative : celle-ci nous permis d‟analyser les données quantifiables issues des résultats d‟analyse de laboratoire.
  • L’approche statistique : cette approche nous a permis de grouper les données dans les tableaux de distribution des fréquences sous formes de pourcentages. 

× 100

  • Avec :  P= Pourcentage

Ni = effectif observé

N= effectif total

III.8.  VARIABLES A ETUDIER

  • Fréquence de germes par hôpital
  • Aspect du milieu après enrichissement 
  • Coloration de gram
  • Germes isolés par hôpital 
  • Antibiogramme

III.9. SAISIE ET TRAITEMENT DES DONNEES 

La saisie de nos données a été réalisée à l‟aide du logiciel informatique Microsoft Word 2010 et l‟encodage et traitement de nos données a été réalisé à l‟aide du logiciel  Microsoft Excel 2010 et le logiciel SPSS Version. 25.

III.10. CONSIDERATIONS ETHIQUES

Nous avons présenté notre lettre pour la recherche à l‟institution où nous avons procédé aux analyses de nos échantillons et notre demande a été acceptée. Pendant notre étude nous avons respecté les règles de l‟éthique  médicale en toute conscience et avons respecté l‟anonymat de nos enquêtés.

CHAPITRE IV. RESULTATS

I. Population  des nouveau-nés inclus dans l’étude

Nous avons inclus dans notre étude, 74 (42,3) nouveau-nés à l‟Hôpital Heal Africa, 48

(27,4) à l‟Hôpital Kyeshero et 53 (30,3) à l‟Hôpital Général La charité Maternelle soit un total 175 nouveau-nés (cfr tableau I)

TABLEAU  I.  Population  Des Nouveau-nés Inclus
Hôpital N %
Heal Africa74 42,3 
Kyeshero48 27,4 
La Charité Maternelle53 30,3 
Total175 100 

II. Fréquence de positivité des bactériémies

TABLEAU II.    Fréquence de Bactériémies 
 HEAL AFRICA        KYESHERO           LA CHARITE   TOTAL
                                 N =74    (42,3)            N=48   (27,4)         N=53   (30,3)         N=175   (100)

H.  POSITIVE         22        (29,73)             30      (62,50)         16     (30,19)          68    (38,86) H. NEGATIVE        52       (70,27)             18       (37,50)         37     (69,81)         107  (61,14)

     Au vu de ce tableau, parmi les 175 hémocultures réalisées, 68 ont étés positives soit (38,86) %. Néanmoins l‟hôpital Kyeshero a rapporté le plus de positivité avec un taux de 30(62,50) %.  

III. Aspect macroscopique après enrichissement  

TABLEAU III. Aspect macroscopique Apres Enrichissement

HEAL AFRICA        KYESHERO           LA CHARITE   TOTAL
                                  N =22    (%)           N = 30    (%)            N=16    (%)               N=68     (%)

HEMOLYSE            3           (13,64)        7         (23,33)           1        (6,25)              11    (16,18)

COAGULUM           2           (9,09)         2         (6,67)              8        (50,00)            12    (17,65)

GAZ                          4           (18,18)       7         (23,33)            5        (31,25)           16    (23,53)

TURBIDITE             13         (59,09)      14       (46,67)             2        (12,25)           29   (42,75)

Au vu de ce tableau, la turbidité a été le signe positif le plus observée dans les hémocultures positives après enrichissement avec 29 (42,75).

IV. Répartition globale de souches selon le Gram

TABLEAU IV. Répartition globale de Souches Selon Le Gram

HEAL AFRICA        KYESHERO              LA CHARITE         TOTAL

                                  N =22    (%)               N= 30    (%)              N=16    (%)           N=68   (%)

BGN                    19       (86,36)          27      (90,00)        8    (50,00)                 54       (79,41)

                   CGP                        3         (13,64)           3        (10,00)         8    (50,00)               14        (20,59)

Au vu de ce tableau, parmi les 68 hémocultures positives, 54 cas soit 79,41 %  avaient révélé des bacilles à Gram négatif alors que 14 cas soit 20,59 % avaient révélé  les coques à Gram positif.

V. Répartition des germes isolés

TABLEAU   V. Répartition de Germes Isoles

                                                                        HEAL AFRICA        KYESHERO        LA CHARITE      TOTAL             

                                               N =22   (%)            N= 30 (%)          N=16    (%)            N=68   (%)

 Staphylococcus aureus     3           (13,64)        2        (6,67)         8     (50,00)           13   (19,12 ) Klebsiella pneumoniae      4         (18,18)        4       (3,33)         4    (25,00)          12  (17,65)

Pseudomonas spp                     6           (27,27)       6       (20,00)        0    (0,00)            12   (17,65)
Escherichia coli       3           (13,64)               5      (16,67)       2    (12,50)        10  (14,71)
                                                                                                              
Enterobacter spp         2           (9,09)          4      (13,33)         0       (0,00)           6       (8,82)
Acinetobacter spp       0          (0,00)            5      (16,67)          0       (0,00)            5    (7,35)
Klebsiella oxytoca                     2          (9,09)                    1       (3,33)          0     (0,00)        3   (4,41)
                    Escherichia paracoli        2          (9,09)                   0       (0,00)          1      (6,25)        3    (4,41)

Pseudomonas                     0        (0,00)             1         (3,33)         1      (6,25)           2    (2,94)

                   aeruginosa                                                                                           

                   Klebsiella ozaenae            0          (0,00)              1       (3,33)          0       (0,00)        1     (1,47)

Staphylococcus                 0           (0,00)          1       (3,33)            0      (0,00)           1     (1,47) haemolyticus                                                                                     

Au vu de ce tableau, Pseudomonas spp a été  le germe le plus isolé à l‟hôpital Heal Africa et  Kyeshero avec  6  cas soit (27,77) % et 6 cas soit (20,00)% ,  le Staphylococcus aureus  a été le plus isolé à l‟hôpital La charité maternelle avec 8(50,00) %  , et d‟une manière globale, Staphylococcus aureus a été le germe le  plus isolés dans toutes les hémocultures réalisées avec 13 cas soit 19,12%.

VI. Sensibilité aux antibiotiques des souches d’Escherichia coli isolées

TABLEAU  VI. Résultat de la sensibilité des souches d’Escherichia coli isolées 

 Antibiotiques testés              sensible                    intermédiaire               résistant 

                                                                       N       (%)                N       (%)                       N          (%)   
AMIKACINE                  7(70)  1       (10)                  2     (20)
AMOXICILLINE               1(10) 1       (10)     8    (80)
AMPICILLINE                 0 (0) 0        (0)     10     (100)    
CIPROFLOXACINE      5(50) 0        (0)      5     (50)
CEFTRIAXONE              2(20) 0        (0)      8     (80)
GENTAMICINE              7(70) 0        (0)      3     (30)
LEVOFLOXACINE      3(30) 0        (0)      7      (70)
COTRIMOXAZOLE      1(10) 0        (0)      9      (90)

Vu ce tableau, nous constatons que Escherichia coli a été  sensible  70%  à l‟amikacine.

                           VII.     Sensibilité aux antibiotiques des souches Klebsiella pneumoniae  isolées

TABLEAU  VII.  Résultat de la sensibilité des souches de Klebsiella pneumonia isolées 

Antibiotiques testés                sensible                    intermédiaire               résistant 

                                                                                      N       (%)                 N         (%)                     N          (%)

AMIKACINE                 6(50)      2(16,67)     4    (33,33)
AMOXICILLINE           3(25)      1(8,33)     8    (66,67)
AMPICILLINE               0(0)        0(0)            12     (100)
CIPROFLOXACINE    4(33,33) 1(8,33)     7     (58,33)
CEFTRIAXONE            2(16,67) 1(8,33)     9     (75)
GENTAMICINE            4(33,33) 0(0)            8     (66,67)
LEVOFLOXACINE    3(25)      0(0)            9     (75)
COTRIMOXAZOLE    2(16,67) 0(0)            10     (83,33) 

                       Au vu de ce tableau, nous constatons que Klebsiella pneumonia présente une sensibilité de  

50 % à l‟amikacine.

VIII. Sensibilité aux antibiotiques des souches de Pseudomonas spp isolées

TABLEAU  VIII.  Résultat de la sensibilité des souches de Pseudomonas spp isolées 

 Antibiotiques testés                   sensible                    intermédiaire              résistant  
    N       (%)                  N         (%)                    N           (%)
AMIKACINE                               5(41,67)              0         (0)                       7           (58,33)
AMOXICILLINE                         2(16,67)              0         (0)                       10     (83,33)
AMPICILLINE                            0(0)                     0         (0)                       12     (100)
CIPROFLOXACINE                   8(66,67)              0         (0)                        4         (33,33)
CEFTRIAXONE                          4(33,33)              1         (8,33)                   7          (58,33)
GENTAMICINE                          7(58,33)              0         (0)                        5        (41,67)
LEVOFLOXACINE                    8(66,67)              0         (0)                        4        (33,33)
COTRIMOXAZOLE                   2(16,67)              0         (0)                        10    (83,33)

Au vu de ce tableau, Pseudomonas spp présente une sensibilité de 66,67 % au ciprofloxacine et au lévofloxacine.

IX. Sensibilité aux antibiotiques des souches de Staphylococcus aureus isolées

TABLEAU  IX. Résultat de la sensibilité des souches de Staphylococcus aureusisolées  

Antibiotiques testés              sensible                                                            intermédiaire              résistant  
    N        (%)                 N          (%)                    N          (%)
 CEFIXIME                                  0        (0)                   2          (15,38)               11        (84,62)
 AMYKACINE                             9       (69, 23)            0          (0)                      4          (30,77)
 AMOXICILLINE                        8       (61,54)             1          (7,69)                 4          (30,77)
 ERYTHROMYCINE                  1       (7,69)              1          (7,69)               11         (84,62)
 CIPROFLOXACINE                   2       (15,38)             0          (0)                      10        (76,92)
 CLINDAMYCINE                      8       (61,54)             0          (0)                       5         (38,46)
 COTRIMOXAZOLE                   4       (30,77)             0          (0)                       9         (69,23)
 AMPICILLINE                            0       (0)                    0          (0)                       13    (100)

Au vu de ce tableau, Staphylococcus aureus était sensible à l‟amikacine à 69,23 %.

CHAPITRE V. DISCUSSION DE RESULTATS

Les bactériémies sont des affections graves, surtout chez les nouveau-nés, l’OMS estimait à 47.6% les décès liés à l‟INN (8).

Présentation de la fréquence des bactériémies

Dans notre étude nous avons réalisé au total, 175 hémocultures dans lesquelles 65 (38,86%) (TABLEAU II) représentaient des cultures positives. Plusieurs études menées au Maroc ont rapporté des taux de positivité proches de 39.33%  [23], 34,9 % , 36,5 % [24]. 

Cependant ce nombre reste élevé par rapport à d’autres études telle que celle de Okalla

Ebongue et al ont observés au Cameroun en 2014  un taux de positivité moindre de 12,8 % [25].  De même, Un taux de positivité également inférieur a été retrouvé par Mallat et al et Mahjoubi et al où les hémocultures étaient positives entre 12 % et 10,5 % des cas, respectivement. Ce faible rendement pourrait être  dû à la difficulté de détection de bactériémies.

Présentation de résultat par rapport à la coloration de Gram

 Parmi les 68 cas d’hémocultures positives, la coloration de Gram  a montré  une prédominance totale des bactéries   à Gram négatif   par rapport aux bactéries  à Gram positif  avec 14  cas soit  (20,59).

Ce qui se rapproche  de l‟étude menée en 2016  par  Gupta et Kashyap en inde, qui avait trouvé également  une prédominance  des bactéries  à Gram négatif dans  58,34% de cas [26].    

Contrairement à l‟étude menée par  Benzriouil qui avait  observé une prédominance des bactéries à Gram positif à  70,44 % [27].    . 

Notre résultat est interprété par le fait que l‟utilisation des  divers dispositifs médicaux, auxquels certaines bactéries à Gram positif sont directement associées, ainsi qu‟aux différentes portes d‟entrée déterminent la prédominance des agents infectieux aussi l‟écologie bactérienne dans chaque hôpital  au pays peut varier et faire évoluer les bactériémies.

Présentation de résultat par rapport aux germes isolés

                        Dans notre étude nous avons constaté que parmi les 11 souches de bactéries isolés,

Staphylococcus aureus a été le germe le plus isolé d‟une manière globale avec 13 cas soit    19,12 %  ce qui se rapproche d‟une étude menée par A.M ANDRIANA RIVELO à  Befelatanana qui a constaté que Staphylococcus était le germe le plus isole cependant avec une proportion de 42,14%  [28].    Comparé à notre étude cet écart serait dû à une fréquence élevée des coques

Gram positif dans leur milieu d‟étude contrairement à notre site [30]. Contrairement aux résultats d‟une étude menée par BENYERBHA Asma   qui avait trouvé que c‟est Klebsiella pneumonie qui est le germe le plus isolés avec 35,29% [29].  

 Nous avons constaté dans notre étude, les germes les plus isolés ont été le Staplycoccus aureus 13(19,12%), Klebsiella pneumoniae 12(17,65%), Pseudomonas spp 12(17,65%), et

Escherichia coli 10 (14,71%). Ceci traduit les différentes portes d‟entrée du germe qui seraient qui sont soit manuportées cas des Entérobacterales, soit par les germes de l‟environnement hospitalier tel que le Pseudomonas et le Klebsiella pneumoniae, surtout avec l‟utilisation des matériels médicaux et implants. La présence du Staphylococcus aureus montre une contamination d‟origine cutanée.         

Présentation de résultat par rapport à l’antibiogramme

Notre étude a montré une sensibilité des souches d’Escherichia coli face à l‟amikacine à un seuil de 70%. Nos résultats sont proche de l‟étude menée par Ben Hamed et al qui ont trouvé à Sfax en Tunisie près de 82% de sensibilité à l‟amikacine pour les souches d‟Escherichia coli isolés [29].   

Nous avons observé une sensibilité à 66,67 % de souches de Pseudomonas spp face au levofloxacine et au ciprofloxacine,ce qui est similaire à l‟étude menée par BENMESBHA Kamilia qui a démontré que les fluoroquinolones (LEV et CIP) ont été les antibiotiques les plus efficaces contre les germes de Pseudomonas spp isolés [30].  Une étude menée par Banik et Al a démontré des résultats similaires avec une sensibilité de 66,7 %  à la  ciprofloxacine [30].

Dans notre étude, nous avons constaté que Klebsiella pneumonia a présenté une sensibilité de   50 % à l‟amikacine. L‟étude menée par BENMESBHA avait  montré, environ 73% de sensibilité observée pour l‟amikacine ce qui est différent de résultats observés dans notre étude, nous pensons cette différence serait due à une forte résistance des souches de Klebsiella, un germe hospitalier qui est dans la plupart des cas résistant aux différents antibiotiques [30].

 Dans l‟étude menée à l‟hôpital laquintinie les auteurs ont  trouvé  une sensibilité de 77,2 %, en plus au motif cité ci-haut, l‟antibiothérapie probabiliste pourrait être  à la base  de la sélection de souches résistantes  face aux antibiotiques sans oublier l‟évolution des germes au fil du temps.

Dans notre étude nous avons constaté que les souches de Staphylococcus aureus étaient sensibles à l‟amikacine à 69,23 %Ce qui est proche de l‟étude menée à l‟hôpital laquintinie qui a observé une sensibilité de cocci gram positifs de 70 % à l‟amikacine [9]. 

Dans notre étude, l‟amikacine a été  l‟antibiotique le plus efficace, vu que la plupart des souches testées représentées ci-haut y étés sensible à des proportions significatives, également la ciprofloxacine et la lévofloxacine pour les souches de Pseudomonas spp  testées.

CHAPITRE VI. CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS

VI. 1. CONCLUSION 

Les bactériémies chez les nouveau-nés constituent un problème majeur de santé publique.

Pendant   notre étude, les résultats obtenus ont montré une fréquence des hémocultures positives élevée.

 Sur le plan bactériologique nous avons isolé plusieurs  souches en général sont : Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumonie, Pseudomonas spp, Escherichia coli, Enterobacter spp, Acinetobacter spp, Klebsiella oxytoca, Escherichia paracoli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella ozaenae et S. haemolyticus. Le germe le plus isolés a été  le Staphylococcus aureus.

Nous avons également observé que parmi les antibiogrammes réalisés que l‟amikacine reste l‟antibiotique le plus efficace et c‟est l‟un des antibiotiques à utilisés en première ligne  malgré l‟augmentation de taux de résistance des germes isolés dans les hémocultures.

En bref, il faut une forte   surveillance dans la prise en charge des bactériémies chez les nouveaunés, y compris les moyens préventifs, curatifs mais aussi dans le diagnostic.

VI. 2. RECOMMANDATIONS

        –    Aux administrateurs et gestionnaire des hôpitaux

ü Veuillez à la dotation des plateformes techniques pour permettre la mise en évidence des germes responsables de bactériémies à fin d‟améliorer la prise en charge.

        –    Aux personnels sanitaires
  • Veuillez à renforcer les mesures d‟hygiène à fin d‟éviter toute sorte de contamination nosocomiales.
  • Veuillez au diagnostic et à la prise en charge précoce des infections urinaires chez les femmes enceintes afin de prévenir la prédisposition des infections néonatales chez les nouveau-nés.
  • Eviter l‟antibiothérapie probabiliste afin de  réduire la résistance des antibiotiques pouvant y  être associée.
        –     Au relais communautaire

ü Renforcer les campagnes de sensibilisation des femmes afin de prendre conscience de la gravité des infections néonatales avec leur impact sur la santé des nouveau-nés. 

BIBLIOGRAPHIE
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~  EE ~ 31

  ANNEXES

~ FFA  ~

EXTRAIT DU SCHEMA D’IDENTIFICATION BIOCHIMIQUE DES BACTERIES D’INTERET MEDICAL

IDENTIFICATION DES FERMENTEURS (Glucose sur milieu KLIGLER) [2].

~ GGB  ~

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